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发布时间:2024-07-03 20:24

如何优化生物样本收集以满足未来的需求。

2018年7月9日

随着对生物学的需求继续增加,生物数据库必须制定策略,以优化其生物素质收集的实用性,效率和范围。现代技术解决方案不仅必须解决样本跟踪和注释,还可以在可能的情况下启用样本共享。如何实现这一目标?

曾几何时,生物样本被收集并用于单一的、特定的研究目的——当提出另一个研究问题时,就会收集另一个样本进行另一个实验。当然,那些日子已经一去不复返了——现代研究依赖于大量的、注释良好的生物样本收集,这些样本可以用于多个研究项目。

生物库和生物样本库通过为研究人员提供样本存储空间和基础设施,填补了这一需求。但是现代研究中高通量测序和筛选策略的出现加速了对专门生物样本收集的需求。如何实现这一目标?

为了满足未来的需求,至少有三个方面很重要。

首先,Biosample系列中的样品数和生物开发品种应通过强化样品采集增加。其次,应改善集合中的样品访问,并采用样品跟踪和注释更全面,精确 - 不影响捐助者隐私。第三,应促进样本共享。虽然第一个方面可能主要属于医院和研究组织的责任,但第二两个与生物数据库的运作活动直接相关。

国际运营生物储存库的主要资产之一betway官网开户app是他们提供样品管理专业知识的能力。提供精确,彻底和可靠的样本跟踪和样本信息可以称为生物素质集合中存在的不同样品类型和生物学中的数量。

然而,对于生物仓库来说,从生物标本采购网站获取(和集成)样本信息并不总是容易的。最近的努力显示了使用现有开源工具在诊所和生物库之间进行数据集成的可行性。这给人们带来了希望,即这种整合可能很快就会变得更容易。1

在生物样本收集中精确的样本跟踪允许下游的样本巩固和重新定位,如果有必要,根据投资回报考虑。2更重要的是,准确且详细的BioPexecen注释允许从Biosample集合中选择精确的样本,为客户提供每个单独的研究项目或应用程序。特别是,实用程序是一个数据库,可以通过易于导航的用户界面来集成和访问来自多个源的示例跟踪和其他信息。

布鲁克斯生命betway官网开户app科学的BioStudies™样本数据系统.

该系统有几个关键功能,可以在尝试满足未来的生物素质需求时提供帮助。它通过跟踪处理步骤来帮助评估样本质量,每个样本都经历了并产生了数据。它还集成了从样本处理工作流程,捐助者同意,表型专利级别和临床数据的实时样本跟踪数据。这允许易于确定任何特定客户端项目的生物集合中任何给定的样品的适用性。

值得注意的是,软件中的多个访问级别提高了数据的安全性和保密性。每个用户可能获得不同程度的数据访问取决于清除级别。当然,患者可识别的数据和敏感信息总是在数据库中进行加密。

即使有了这些改进,生物贮藏也可能投资于样本共享策略,以满足未来的需求。在这里,出色的样本跟踪也是关键。最近的努力已经产生了跨多个生物库共享样本元数据的工具,这对需要稀缺生物样本的研究人员(即研究罕见疾病的科学家)来说是一项最重要的策略。3.

目前受到了从生物素集合中获取样本数据的公开访问,因此在不同的Biobanks之间因此在不同的Biobanks之间疯狂地变化。4这应该改变并进行标准化。

简化生物数据库中样本注释的最低要求的努力正在进行中,5这将让科学家从全世界的集合中确定特定样本。在所有这些努力中,应认真对待涉及隐私问题的捐助者担忧,生物分享必须纳入有关捐助者同意的严格规则。betway88必威betway88必威6

随着一流的样本跟踪和注释解决方案以及样本共享政策和方法的投入,生物仓库将为未来提供良好的装备。

参考文献

1.Bouzille G, Jouhet V, Turlin B, Clement B, Desille M, Riou C等。将生物样本库数据整合到临床数据研究网络:IBCB项目。螺柱健康技术信息.2018.247:16-20。
2.国家历史和当代生物馆藏资源的高效维护:NHLBI生物储存库模型。BiopreServ Biobank..2017.15(1): 17 - 19。doi: 10.1089 / bio.2016.0112。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5326980/
3.acta photonica sinica, 2011, 32(5): 689 - 693。RD-Connect注册和生物样本库查找器:一个在罕见疾病研究人员之间共享聚合数据和元数据的工具。Eur J Hum Genet.2018.doi: 10.1038 / s41431 - 017 - 0085 - z。https://www.nature.com/articles/s41431-017-0085-z
4.Langhof H, Kahrass H, Sievers S, Strech D.生物样本库研究中的获取政策:它们包括哪些标准?它们的公开程度如何?一个横断面研究。Eur J Hum Genet.2017.25(3): 293 - 300。doi: 10.1038 / ejhg.2016.172。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/pmc5315509/
5. Merino-Martinez R,Norlin L,Van Enckevort D,Anton G,Schuffenhauer S,Silander K,等。通过实施BioBank数据共享的最低信息(MIABIS 2.0核心)来实现全球BIOBANK集成。BiopreServ Biobank..2016.14(4): 298 - 306。doi: 10.1089 / bio.2015.0070。https://www.liebertpub.com/doi/10.1089/bio.2015.0070
6. KlingStrom T,Bongcam-Rudloff E,Reichel J.共享生物开发时的法律和道德合规性。短暂的功能基因组学.2018.17(1): 1 - 7。doi: 10.1093 / bfgp / elx008。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5859993/

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